土壤是以固相物质为主的多相的复杂体系。它是岩石圈经过生物圈、大气圈和水圈长期和深刻的综合作用影响形成的。因此，土壤是陆地生态系统的组成要素或子系统。以土壤为中心由土壤与其环境条件组成的系统称为土壤生态系统。它有各种复杂多变的组成，特定的结构、功能和演变规律。在土壤生态系统中，物质和能量流不断地由外界环境向土壤输入，通过土体内的迁移转化，必然会引起土壤成分、结构、性质和功能的改变，从而推动土壤的发展与演变；物质和能量流从土壤向环境的输出，也必然会导致环境成分、结构和性质的改变，从而推动环境的不断发展。然而，土壤生态系统也具有一定调节FAG为，以保持相对平衡和稳定。所以土壤生态系统是一个为物质流和能量流所贯穿的开放系统，当人们从土壤中索取生物产品时，如果过度，而不给土壤归还或补充从其中取走的成分，最后必将受惩罚。
土壤在陆地生态系统中处于各环境要素紧密交接的地带，是连接各环境要素的枢纽，也是结合无机界和生物界的中心环节。因此，土壤生态系统是控制陆地生态系统的中央枢纽，是所有环境要素物质和能量迁移转化最为复杂和活跃的场所。而且，由于土壤和植物密切联系，构成陆地生态系统的核心，使土壤成为陆地生物食物链的首端。
应该强调指出，土壤生态系统既是自然生态系统，也是人类智慧和劳动可以支配的人工生态系统或复合生态系统。土壤生态系统的功能是和土壤的功能一致的。
1．土壤生态系统的组成
土壤生态系统与其他自然生态系统的组成一样，主要分为：生命有机体部分，即植物和土壤微生物等；非生命无机环境部分，即太阳光、大气、母岩与母质，地表形态及土壤矿物质、水分和空气等。土壤生态系统的生物部分，根据在系统中物质与能量迁移转化中的作用，又可分为三个部分：生产者、消费者和分解者。
（1）第一性生产者
第一性生产者也叫初级生产者，包括所有的绿色植物和利用化学能的细菌等，是生态系统中最积极和最稳定的因素。生产者主要是指绿色植物，绿色植物能利用光能把CO2和HO2转变成碳水化合物，即通过光合作用把一些能量以化学键能的形式储存起来，为以后利用做准备。它们是土壤生态系统的基石，同时也是农业生态系统的基础。因为没有第一性生产者，任何生态系统都不会有物质流和能量流。
(2) 消费者
消费者是不能用无机物质制造有机物质的生物。它们直接或间按地依枚于土产有所制造的有机物质，被称为异养生物。根据食性的不同可分为以下几类。草食动物是以植物为营养的动物，又称植食动物，是初级消费者，如昆虫、啮齿类、马、牛、羊等；肉食动物是以草食动物或其他动物为食的动物。据其在食物链中所处的位置，又可以分为：一级消费者、二级消费者和三级消费者。
(3）分解者
分解者又称还原者，主要是细菌、真菌和某些腐生生活的原生动物和小型土壤动物（例如甲虫、白蚁、某些软体动物等）。它们把酶分泌到动植物残体的表面或内部，酶能把生物残体消化为极小的颗粒或分子，并最终分解为无机物质归还到环境中，再被生产者利用。
它们在生态系统的物质循环和能量流动中，具有重要的意义，大约有90％的初级生产量，都须经过分解者分解回还大地；所有动物和植物的尸体和枯枝落叶，都必须经过分解者进行分解，如果没有还原者的分解作用，地球表面将堆满动植物的尸体残骸，一些重要元素就会出现短缺，生态系统就不能维持。虽然，从能量的角度来看，分解者对生态系统是无关紧要的，但从物质循环的角度看，它们是生态系统不可缺少的重要部分。
2．土壤生态系统的结构
达到平衡的土壤生态系统具有一定的结构特征。首先，依据土壤生态系统中地表和土壤环境条件的差异以及与此相关联的生物群体的种类、数量和它们在生态系统中所起的作用，可以划分出土壤生态系统的垂直结构和水平结构。垂直结构一般由如下三个主要层次构成。
（1) 地上生物群体层
主要为绿色植物（乔木、灌木、草本植物等）组成的生物群体，是进行光合作用的主要场所，所占空间的高度范围依植物种类而异。
(2）土被生物群落层
包括地面（枯枝落叶层）及植物担系所及的土被层的生物群体。本层是土壤生物群体（土壤动物、微生物、藻类等）的主要聚积层，是有机质生物累积、分解、转化，矿物质风化、淀积、迁移转化，水分淋溶、蒸发蒸腾，以及能量输入输出、交换的最为复杂和活跃的场所。
(3)土被底层与风化壳生物群体层
土被底层与风化壳生物群体层生物群体剧减，生物有机体少，是土壤生态系统矿质元素的主要补给基地。其垂直结构有的很复杂，如森林土壤生态系统，不论其地上生物群体（植物和动物）还是土被生物群体层，层状分布都异常明显；而有的土壤，如荒漠土壤或原始土壤生态系统，都较为简单。
其次，土壤生态系统不仅具有垂直结构，由于土壤环境条件的空间分异，土壤生物群落组合也可产生水平差异。而且具有一定的水平结构或空间格局。
