我国江河湖库及近海海域受到不同程度的污染。海河、辽河、淮河、巢湖、滇池、太湖污染严重，七大水系中，不适合作饮用水源的河段已接近40%；工业较发达城镇河段污染突出，城市河段中78％的河段不适合作饮用水源；城市地下水90％受到不同程度的污染。
1．七大水系
长江水系水质符合I、II类水质标准的河段为38.8%，符合ul类标准的为33.7％，符合Ⅳ.V类标准的为27.5%。主要污染参数为高锰酸盐指数和石油类，个别河段铜超标。长江干流水质总体较好，但干流岸边污染严重，干流城市江段的岸边污染带总长已达500km。黄河水系全流域水质符合Ⅰ、II类水质标准的河段占8.2%，符合Ⅲ类标准的为26.4%，符合Ⅳ.V类标准的为65.4%。主要污染参数为氨氮、高锰酸盐指数和挥发酚。淮河水系水质符合I.II类水质标准的河段占17.6%，符合Hi类标准的占31.20%，符合Ⅳ、V类标准的占51.2%。主要污染参数为氨氮、高锰酸盐指数。海河水系水质符合Ⅰ、Ⅱ类水质标准的河段为39.7%，符合班类标准的为19.2%，符合Ⅳ、V类标准的为41.1%。主要污染参数为氨氮、高锰酸盐指数、生化需氧量和挥发酚。松花江、辽河水系水质符合Ⅰ、II类标准的仅占2.9%，符合班类标准的占24.3%，符合Ⅳ.V类标准占72.8%。松花江水系主要污染参数是总汞、高锰酸盐指数、氨氮和挥发酚。辽河水系绝大部分河流水质超过地面水Ⅴ类标准，主要污染参数为氨氮、高锰酸盐指数和挥发酚，铜、氰化物，汞也有超标现象。珠江水系水质总体较好，部分支流河段受到污染。水质符合Ⅰ、II类标准的河段为49.5%，符合Ⅲ类标准的为31.2%，符合Ⅳ.V类标准的为19.3%。主要污染参数为氨氮、高锰酸盐指数和砷化物。
2．河流城市段
在统计的城市河段中，目前有87％左右的河段受到不同程度的污染。其中有16％的城市河段属严重污染，有11％的城市河段属重度污染，有15％的城市河段属中度污染，有33％的城市河段属轻度污染，有23％的城市河段水质较好。
从污染特征来看，城市河流呈有机型污染，主要污染物为石油类、氨氮和挥发酚。重金属类的污染相对较轻，但部分地区总汞的污染也比较严重。
3．湖泊水库
太湖受总磷、总氮的影响，富营养化严重。全湖总磷、总氮在IV-V类之间，局部区域如梅梁湖牙五里湖区除富营养化外，有机污染也非常严重。多数人湖河流及流域内城镇附近的河流污染严重。滇池草海水质为V类，外海水质为Ⅲ、Ⅳ类。草海有机物、氮、磷等污染物含量很高，水体发黑发臭。浮游植物大量繁殖，湖内水葫芦疯长，约90％的水面为水葫芦所覆盖；外海的污染稍轻，但有机污染和富营养化均已到较严重的程度。巢湖的富营养化问题由来已久，历史上就经常出现各种藻类异常繁殖而浮于水面，形成密集的“水华”现象。近年来，由于流域内工农业的发展，未处理的废水直接排放、水土流失等人为因素的影响，更加剧了富营养化的程度，富营养化已扩展到全湖，水质日趋恶化。
4．地下水由于地表水污染，造成地下水的污染，污染面已达90%。另外，由于用水量不断增力和地表水污染越来越重，只有靠大量抽取地下水来满足工农业和人民生活的需要，因此造成地下水位下降严重。
5．近岸海域
近岸海域海水受到不同程度的污染。2000年通过全国沿海622典型近海海域海水水质监测结果分析，近海海水水质以超Ⅲ类和Ⅲ类为主，年际间变化不大；无机氮、无机磷和石
油类依然是影响我国近海海域海水质量的主要污染因子。部分海域化学耗氧量超标率较高。重金属污染相对较轻，但铜在渤海和东海的个别海域超标率较高；pH值和溶解氧指标有超标现象。四大海区以东海污染程度最重，渤海次之，南海最轻。全国近岸海域水质评价结果表明，I类海水占18.7%,II类海水占21.4%,Ⅲ类海水占6.5%，超Ⅲ类海水占53.4%。
